台灣自70年代開始推公費施打日本腦炎疫苗，感染人數大幅降低，但時至今日每年仍有20∼30位個案，甚至出現神經性後遺症如語言障礙，台大兒童醫院小兒部醫師李秉穎指出，日本腦炎並未絕跡，且部分家長認為疫苗有群體免疫效果，別人家小孩打過了，自己家小孩就不用打，不過日本腦炎非人傳人，無群體免疫效果，而今年8月即將上市新式活性減毒疫苗，相較傳統要打4劑，現僅須施打2劑，每劑約自費2600∼3000元。
李秉穎醫師表示，群體免疫指的是群體中很大部分接種疫苗者，可以保護少數未接種疫苗的個體，而這觀念也讓部分家長認為自己的孩子不用施打疫苗，可以省麻煩又不用讓孩子受罪，但日本腦炎主要是由蚊子叮咬受感染豬隻，再傳染給人，在台灣又以三斑家蚊為主要媒介，並非人傳人、無群體免疫效果，被叮咬感染後會頭痛、發燒、痙攣，僅能施以支持性療法，也可能有致命疑慮，建議仍應及時接種疫苗。
舊疫苗停產
李秉穎醫師進一步提到，台灣目前公費施打的日本腦炎疫苗為不活化鼠腦劑型，主要運用感染鼠腦組織進行培養，幼兒需注射4劑，雖無實證研究證實，但世界衛生組織仍有疑慮認為鼠腦疫苗製程上未標準化、且需要接種較多劑，連帶讓生產該款疫苗的生技公司停產。
目前國內庫存推估可施打到今年底，後續相關單位會再討論是否以新的疫苗取代公費劑型，而預計在8月上市的細胞型日本腦炎活性減毒疫苗，僅須施打2劑，加上製程以細胞培養，安全性較高，不過現階段仍需自費，每劑約2600∼3000元。
家長可補打
在每年感染日本腦炎的個案中，約有9成為40∼50歲的成年人，李秉穎醫師提到，推測與以往施打的疫苗保護力，每年都逐漸消退有關，因此建議家長們也可在就醫時補打日本腦炎疫苗，而且若居家環境附近有水稻田、養豬戶等高危險族群，更應謹記補打日本腦炎疫苗的重要性。
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